Областной краеведческий музей учрежден решением облисполкома ЕАО и краевого исполкома 5 сентября 1944 года. 10 июня 1945 года в первый раз открыл свои двери для посетителей. Музей состоял из нескольких отделов: «Природа», «Промышленность и сельское хозяйство», «Культурное строительство» и «Еврейская культура».